| Валерий Гончарук | Добрый день!
Делаю приложение для себя (некоммерческое, с открытым исходным кодом) по лишайникам. Хотел бы добавить ссылку на страницу Плантариума с таксоном. Ну, кликаешь в приложении на ссылку, и в браузере открывается страничка Плантариума.
Чтобы собрать URL для перехода, проще всего знать ID таксона в системе Плантариума. ID есть на странице, но парсить сайт не хочу, а руками слишком долго.
Нашёл готовые материалы на https://www.binran.ru/, но там исключительно виды без вышестоящих таксонов. А из тоже бы хотелось.
Есть ли срез дерева таксонов Плантариума или дампа базы данных с ID таксона в системе?
Заранее спасибо! |
| Дмитрий Орешкин | Постоянного и в открытом доступе нет.
Возможно, вам поможет возможность ссылаться на таксон по названию.
Например:
https://www.plantarium.ru/ref/Cladonia stellaris
https://www.plantarium.ru/ref/Poa pratensis ssp. skrjabinii |
| Валерий Гончарук | Дмитрий Орешкин пишет:Постоянного и в открытом доступе нет.
Возможно, вам поможет возможность ссылаться на таксон по названию.
Например: https://www.plantarium.ru/ref/Cladonia stellaris
Спасибо! Я подумаю, как это можно использовать, но уже вижу несколько сложностей.
У меня таксономическое дерево GBIF. И, например, они объединили этой осенью Flavocetraria и Nephromopsis, и теперь на Плантариуме https://www.plantarium.ru/ref/Flavocetraria nivalis будет работать, а https://www.plantarium.ru/ref/Nephromopsis nivalis нет.
Конкретно в этом случае у меня есть ID благодаря БИнРАН и я могу "подтянуть" его из синонимов. С более высокими рангами могут быть вопросы.
Надеюсь, когда-нибудь срезы появятся, как это у MicoBank или CBIF.
Ещё раз спасибо! |
| Дмитрий Орешкин | Если комбинации в принципе нет в базе, так её никаким образом и не достанешь.
Синонимика в базе данных "Плантариума" менее богатая, но понемногу пополняется. |
| Валерий Гончарук | Добрый день!
Тестировал правильность перехода по ссылке на сайт Плантариума, и возник вопрос. Вы собирали дерево таксонов лихенофлоры по книге "Список лихенофлоры России" - СПб, Наука, 2010 - 194 с. или использовались какие-то другие базы данных? Интересует только дерево таксонов лихенофлоры.
Вопрос возник в связи с именем таксона https://www.plantarium.ru/page/view/item/75150.html |
| Дмитрий Орешкин | Сначала - да. Потом вносились изменения и дополнения, преимущественно по Species Fungorum.
По Lecanora accedens пока ничего сказать не могу, нужно найти исходный файл. |
| Валерий Гончарук | Спасибо!
Этой информации достаточно. Этого таксона нет в базах MycoBank, IndexFungorum, GBIF, iNat. Покопаю литературу и статьи ещё, если не найду описание и ссылки, нужно будет писать в БИнРАН Комарова с вопросами. |
| Дмитрий Орешкин | Фрагмент исходного файла:
LECANORA Ach. in Luyken (1809)
Lecanora accedens H. Magn.
Distr.: Sa (UPS) |
| Валерий Гончарук | Дмитрий Орешкин пишет:Фрагмент исходного файла:
Да, это из "Список лихенофлоры России".
Я порылся немного. Это голотип хранящийся в гербарии Museum of Evolution в Швеции. Как я понимаю, M. Brenner привез его из Дудинки за 9 лет до рождения Хуго Магнуссона, который его описал в работе Magnusson A. H. 1939. Studies in species of Lecanora, mainly the Aspicilia gibbosa group. Kungl. Svenska Vetenskaps-Akademiens Handlingar. Ser. III. 17(5): 1–182.
Саму работу так и не нашёл в открытом доступе.
В "Список" она вошла как голотип из гербария. И больше нигде не появляется.
Спасибо, что отозвались! |