| Adiantaceae (Адиантовые) |
| 1. | | Cheilanthes pteridioides (Reichard) C. Christ. | Краекучник орляковый (Краекучник птерисовый) |
| Alliaceae (Луковые) |
| 2. | | Allium eugenii Vved. | Лук Евгения |
| 3. | | Allium monophyllum Vved. ex Czerniak. | Лук однолистный |
| 4. |  | Allium paradoxum (M. Bieb.) G. Don | Лук странный |
| 5. | | Allium transvestiens Vved. | Лук переодевающийся |
| 6. | | Allium vavilovii Popov & Vved. | Лук Вавилова |
| Amaryllidaceae (Амариллисовые) |
| 7. | | Sternbergia lutea (L.) Spreng. | Штернбергия жёлтая |
| 8. | | Ungernia spiralis Proskor. | Унгерния спиральная |
| 9. | | Ungernia victoris Vved. ex Artjush. | Унгерния Виктора |
| Anacardiaceae (Сумаховые) |
| 10. | | Pistacia badghysi K.P. Popov | Фисташка бадхызская |
| Apiaceae (Сельдерейные, Зонтичные) |
| 11. | | Smyrnium cordifolium Boiss. | Смирния сердцелистная |
| Asparagaceae (Спаржевые) |
| 12. | | Asparagus turkestanicus Popov | Спаржа туркестанская |
| Asphodelaceae (Асфоделиевые) |
| 13. | | Eremurus kopetdaghensis Popov ex B. Fedtsch. | Эремурус копетдагский (Ширяш копетдагский) |
| Aspleniaceae (Костенцовые) |
| 14. | | Asplenium adiantum-nigrum L. | Костенец чёрный |
| 15. | | Asplenium trichomanes L. | Костенец волосовидный |
| 16. | | Ceterach officinarum Willd. | Скребница аптечная (Костенец аптечный, Скребница лекарственная) |
| Asteraceae (Сложноцветные, Астровые) |
| 17. | | Artemisia dimoana Popov | Полынь Димо |
| 18. | | Centaurea androssovii Iljin | Рапонтикоидес Андросова (Василёк Андросова) |
| 19. | | Centaurea iljinii Czerniak. | Псефеллюс Ильина (Василёк Ильина) |
| 20. | | Centaurea kopet-daghensis Iljin | Псефеллюс копетдагский (Василёк копетдагский) |
| | В оригинале - Centaurea kopetdaghensis Iljin |
| 21. | | Cousinia badhysi Kult. | Кузиния бадхызская |
| | В оригинале - Cousinia badghysi Kult. |
| 22. | | Cousinia tschernevae Berdyev | Кузиния Черневой (Кузиния Черновой) |
| 23. | | Jurinea karabugasica Iljin | Наголоватка карабогазская (Наголоватка карабугазская) |
| 24. | | Lactuca rosularis Boiss. | Латук розеточный (Лактук розеточный) |
| 25. | | Lasiopogon muscoides (Desf.) DC. | Лазиопогон моховидный |
| 26. | | Lepidolopha fedtschenkoana Knorring | Лепидолофа Федченко |
| 27. | | Phagnalon androssovii B. Fedtsch. | Фагналон Андросова |
| 28. | | Senecio khorossanicus Rech. f. & Aellen | Крестовник хорасанский |
| 29. | | Siebera nana (DC.) Bornm. | Зибера карликовая |
| 30. | | Tanacetopsis kjurendaghi Kurbanov | Танацетопсис кюрендагский (Склерорахис кюрендагский) |
| Brassicaceae (Капустные, Брассиковые, Капустовые, Крестоцветные) |
| 31. | | Aethionema kopetdaghi Lipsky | Крылотычинник копетдагский |
| 32. | | Erysimum kerbabaevii Kurbanov & Gudkova | Желтушник Кербабаева |
| 33. | | Prionotrichon gaudanense (Litv.) Botsch. | Прионотрихон гауданский (Перистоволосник гауданский) |
| Capparaceae (Каперсовые) |
| 34. | | Cleome gordjaginii Popov | Клеоме Гордягина |
| 35. | | Cleome turkmena Bobr. | Клеоме туркменская |
| Caryophyllaceae (Гвоздиковые, Гвоздичные) |
| 36. | | Silene czopandagensis Bondar. | Смолёвка чопандагская |
| Chenopodiaceae (Маревые) |
| 37. | | Climacoptera czelekenica U.P. Pratov | Климакоптера челекенская |
| 38. | | Salsola botschantzevii Kurbanov | Солянка Бочанцева |
| 39. | | Salsola chiwensis Popov | Солянка хивинская |
| 40. | | Salsola iljinii Botsch. | Солянка Ильина |
| 41. | | Salsola lipschitzii Botsch. | Солянка Липшица |
| 42. | | Salsola transhyrcanica Iljin | Солянка закаспийская |
| Cladoniaceae (Кладониевые) |
| 43. | | Cladonia pyxidata (L.) Hoffm. | Кладония крыночковидная (Кладония бокальчатая) |
| Cucurbitaceae (Тыквенные) |
| 44. | | Bryonia monoica Aitch. & Hemsl. | Переступень однодомный (Бриония однодомная) |
| Euphorbiaceae (Молочайные) |
| 45. | | Euphorbia oidorhiza Pojark. | Молочай вздутокорневой |
| Fabaceae (Бобовые, Мотыльковые) |
| 46. | | Ammodendron eichwaldii Ledeb. | Песчаная акация Эйхвальда |
| 47. | | Astragalus kelifi Lipsky | Астрагал келифский |
| 48. | | Astragalus kjurendaghi V.V.Nikit. | Астрагал кюрендагский |
| 49. | | Astragalus kuschkensis Boriss. | Астрагал кушкинский |
| 50. | | Astragalus vassilczenkoi Berdyev | Астрагал Васильченко |
| 51. | | Colutea atabaevii B. Fedtsch. | Пузырник Атабаева (Пузырник копетдагский) |
| | В оригинале - Colutea atabajevii B. Fedtsch. |
| 52. | | Onobrychis nikitinii Orazmuchommedov | Эспарцет Никитина |
| Fumariaceae (Дымянковые) |
| 53. | | Corydalis kamelinii Kurbanov | Хохлатка Камелина |
| 54. | | Corydalis popovii Nevski ex Popov | Хохлатка Попова |
| Funariaceae (Фунариевые) |
| 55. | | Entosthodon handelii (Schiffn.) Laz. | Энтостодон Ханделя |
| Grossulariaceae (Крыжовниковые) |
| 56. | | Ribes melananthum Boiss. & Hohen. | Смородина темноцветная |
| Hyacinthaceae (Гиацинтовые) |
| 57. | | Hyacinthella transcaspica (Litv.) Chouard | Гиацинтик закаспийский (Гиацинт закаспийский, Гиацинт копетдагский) |
| 58. | | Hyacinthus litwinowii Czerniak. | Гиацинтик Литвинова (Гиацинт Литвинова, Гиацинтелла Литвинова) |
| 59. | | Ornithogalum ponticum Zahar. | Птицемлечник понтийский |
| Iridaceae (Ирисовые, Касатиковые) |
| 60. | | Iridodictyum kopetdaghense Kurbanov | Иридодиктиум копетдагский |
| 61. | | Iris ewbankiana Foster | Ирис Эвбенка (Ирис Евбанка, Касатик Эвбенка) |
| Juglandaceae (Ореховые) |
| 62. | | Juglans regia L. | Орех грецкий |
| Lentibulariaceae (Пузырчатковые) |
| 63. | | Utricularia vulgaris L. | Пузырчатка обыкновенная |
| Liliaceae (Лилейные) |
| 64. | | Fritillaria raddeana Regel | Рябчик Радде (Петилиум Радде) |
| 65. | | Tulipa botschantzevae S.N. Abramova & Zakal. | Тюльпан Бочанцевой |
| 66. | | Tulipa hoogiana B. Fedtsch. | Тюльпан Хога (Тюльпан Гуга, Тюльпан Гугов, Тюльпан Хоога, Тюльпан Хуга) |
| 67. | | Tulipa ingens T.M. Hoog | Тюльпан великий (Тюльпан большой) |
| 68. | | Tulipa kuschkensis B. Fedtsch. | Тюльпан кушкинский |
| 69. | | Tulipa lehmanniana Merckl. | Тюльпан Лемана (Тюльпан Леманновский) |
| 70. | | Tulipa micheliana T.M. Hoog | Тюльпан Микели (Тюльпан Микеля, Тюльпан Михели, Тюльпан Михелиев, Тюльпан Михеля) |
| 71. | | Tulipa wilsoniana T.M. Hoog | Тюльпан Вильсона |
| Malvaceae (Мальвовые, Просвирниковые) |
| 72. | | Alcea karakalensis Freyn | Шток-роза каракалинская |
| 73. | | Alcea sycophylla Iljin & V.V. Nikitin | Шток-роза смоковницелистная (Шток-роза фиголистная) |
| Marsileaceae (Марсилеевые) |
| 74. | | Marsilea aegyptiaca Willd. | Марсилея египетская (Марсилия египетская) |
| Melanthiaceae (Мелантиевые, Осенниковые) |
| 75. | | Colchicum szovitsii Fisch. & C.A. Mey. | Безвременник Совича (Безвременник двулистный, Безвременник снежный, Безвременник Шовица) |
| Moraceae (Тутовые) |
| 76. | | Ficus afghanistanica Warb. | Смоковница афганистанская (Инжир афганистанский, Фикус афганистанский) |
| Ophioglossaceae (Ужовниковые) |
| 77. | | Ophioglossum bucharicum (O. Fedtsch. & B. Fedtsch.) O. Fedtsch. | Ужовник бухарский |
| 78. | | Ophioglossum vulgatum L. | Ужовник обыкновенный |
| Orchidaceae (Орхидные, Орхидеи, Ятрышниковые) |
| 79. | | Dactylorhiza flavescens (K. Koch) Holub | Пальчатокоренник желтоватый (Пальцекорник желтоватый, Пальчатокорник желтоватый, Ятрышник желтеющий, Ятрышник желтоватый) |
| 80. | | Epipactis turcomanica K.P. Popov & Neshat. | Дремлик персидский (Дремлик крымский, Дремлик туркменский) |
| 81. | | Epipactis veratrifolia Boiss. & Hohen. | Дремлик чемерицелистный (Дремлик чемерицевидный) |
| 82. | | Eulophia turkestanica (Litv.) Schltr. | Эулофия туркестанская |
| 83. | | Listera ovata (L.) R. Br. | Тайник яйцевидный (Тайник овальный) |
| 84. | | Ophrys transhyrcana Czerniak. | Офрис сосочковая (Офрис закаспийская, Офрис закаспийский, Офрис кавказская круглогубая, Офрис крымская, Офрис сосочковая круглогубая, Офрис трансгирканская, Офрис трансгирканский, Офрис туркменская) |
| 85. | | Orchis simia Lam. | Ятрышник обезьяний |
| Parmeliaceae (Пармелиевые) |
| 86. | | Parmelia subexasperata Dzhur., nom. inval. | Пармелия шероховатая |
| Peganaceae (Гармаловые) |
| 87. | | Malacocarpus crithmifolius (Retz.) C.A. Mey. | Мягкоплодник критмолистный (Мягкоплодник рассечённолистный) |
| Physciaceae (Фисциевые) |
| 88. | | Physcia biziana (A. Massal.) Zahlbr. | Фисция причудливая |
| 89. | | Tornabea scutellifera (With.) J. R. Laundon | Торнабея щитконосная (Торнабения атлантическая, Торнабея блюдценосная) |
| Plumbaginaceae (Свинчатковые, Плюмбаговые) |
| 90. | | Acantholimon kjurendaghi Mesczer. | Акантолимон кюрендагский |
| 91. | | Popoviolimon turcomanicum (Popov ex Lincz.) Lincz. | Поповиолимон туркменский |
| Polygonaceae (Гречишные, Горцовые, Гречиховые, Спорышевые) |
| 92. | | Atraphaxis badghysi Kult. | Курчавка бадхызская |
| 93. | | Calligonum triste Litv. | Жузгун печальный (Джузгун печальный, Кандым печальный) |
| Pottiaceae (Поттиевые) |
| 94. | | Trichostomopsis aaronis (Lorentz) S. Agnew & C.C. Towns. | Трихостомопсис Аарона |
| Pteridaceae (Птерисовые) |
| 95. | | Anogramma leptophylla (L.) Link | Анограмма тонколистная |
| Punicaceae (Гранатовые) |
| 96. | | Punica granatum L. | Гранат обыкновенный |
| Resedaceae (Резедовые) |
| 97. | | Homalodiscus ochradeni (Boiss.) Boiss. | Охраденус охраденовый (Гомалодискус охраденовый) |
| 98. | | Reseda dshebeli Czerniak. | Резеда джебельская |
| Rosaceae (Шиповниковые, Розанные, Розовые, Розоцветные) |
| 99. | | Crataegus nikitinii Essenova | Боярышник Никитина |
| 100. | | Malus turkmenorum Juz. & Popov | Яблоня Сиверса (Яблоня гиссарская, Яблоня киргизов, Яблоня киргизская, Яблоня Кудряшева, Яблоня неравнолистная, Яблоня персиколистная, Яблоня разнолистная, Яблоня туркменская, Яблоня тянь-шанская, Яблоня Шишкина, Яблоня Юзепчука) |
| 101. | | Pyrus boissieriana Buhse | Груша Буасье |
| 102. | | Pyrus turcomanica Maleev | Груша туркменская |
| 103. | | Sorbus graeca (Spach) Lodd. ex Schauer | Рябина греческая (Рябина Балдаччи) |
| 104. | | Sorbus persica Hedl. | Рябина персидская |
| 105. | | Sorbus turkestanica (Franch.) Hedl. | Рябина туркестанская |
| Scrophulariaceae (Норичниковые) |
| 106. | | Scrophularia kjurendaghi Botsch. & Kurbanov | Норичник кюрендагский |
| 107. | | Scrophularia kurbanovii Botsch. | Норичник Курбанова |
| Solanaceae (Паслёновые) |
| 108. | | Atropa komarovii Blin. & Shalyt | Красавка Комарова |
| 109. | | Mandragora turcomanica Mizg. | Мандрагора туркменская (Мандрагора туркестанская) |
| Tamaricaceae (Гребенщиковые, Тамарисковые) |
| 110. | | Reaumuria botschantzevii Zuckerw. & Kurbanov | Реомюрия Бочанцева |
| Teloschistaceae (Телосхистовые) |
| 111. | | Teloschistes montanus Barkh. | Сейрофора переплетённо-скрученная (Ксантоанаптихия переплетённо-скрученная, Телосхистес горный) |
| Thymelaeaceae (Волчниковые, Волчеягодниковые) |
| 112. | | Dendrostellera turkmenorum Pobed. | Дендростеллера туркменов (Дендростеллера туркменская) |