Лиман расположен в северной части Таманского полуострова — это крупнейший пресный водоём Краснодарского края. С юго-востока в него впадает Казачий ерик, а на северо-западе он соединяется с Азовским морем через гирло. С юга лиман ограждает Старотитаровская возвышенность, изрезанная многочисленными балками и оврагами. На западе поднимается гора Борисоглебская. Северный берег тоже высокий. Зеркало воды от твердого берега отделяет полоса тростниковых зарослей разной ширины.
Мест, где растет лотос, в лимане – три, это искусственные посадки, они были заложены в 1980-х годах.