Урочище Бадаксай протяженностью около 12 км расположено на северо-западном склоне Пскемского хребта. Имеет сильно расчлененный рельеф с крутыми щебнистыми и каменистыми склонами, осыпями и скальными гребнями. Перепад высот: около 1100 м н.у.м. возле впадения речки Бадаксай в реку Пскем, до 3500-3765 м н.у.м. на гребне Пскемского хребта. В средней части урочища, на высоте 1720 м н.у.м., расположено озеро Бадак протяженностью около 1 км и шириной около 250 м. Глубина озера при наибольшем наполнении достигает 23-25 м.