Хребет вытянут в северном направлении, наивысшая высота — 3139 м, склоны изрезаны ущельями и глубокими каньонами. Осадочные породы покрыты серозёмом. На многочисленных плато имеются арчовые редколесья, заросли клёна, вишни, шиповника, полыни; луга высокогорий — злаково-типчаковые. Флора крайне ксероморфна: преобладают эфемеры, стержнекорневые поликарпики и длительно вегетирующие однолетки, наряду с присутствием многочисленных видов поликарпиков и монокарпиков с приспособлениями для накопления влаги в подземных органах. Южной границей Кугитанга является река Амударья с пойменными лугами и лесами (тугаями). На северо-западном (туркменском) склоне хребта имеется уникальное "Плато динозавров" с окаменевшимися следами доисторических ящеров.